Python使用defaultdict读取文件各列的方法

本文实例讲述了Python使用defaultdict读取文件各列的方法。分享给大家供大家参考，具体如下：

#!/usr/bin/python
"""USAGE: python *.py align_SNP_site out_file"""
import sys
#import time
from collections import Counter
#t0=time.clock()
info=open(sys.argv[1])
fast=sys.argv[2]
d_c = {}
d1={}
d2={}
for line in info:
    cols=line.strip().split("t")
    if cols[0] == "SNP pattern":
        continue
    else:
        d1.setdefault(cols[4],[]).append(cols[1])
        d2.setdefault(cols[7],[]).append(cols[1])
    #d1.setdefault(cols[0],[]).append(cols[5])
    #d2[cols[0]] = "t".join(cols[0:3])
info.close()
print len(d1)
print len(d2)
my_list=[]
ref_fa = open("some_example.fasta", 'r')
for i in ref_fa.readlines():
    if i.startswith(">"):
        my_list.append(i.rstrip())
ref_fa.close()
print len(my_list)
#sys.exit()
result = open(fast,'w')
for k,v in d1.iteritems():
    cnt1 = Counter(v)
    #print cnt1
    result.write("%st" % k)
    for i in sorted(cnt1.items(), key = lambda x: x[1], reverse=True):
        result.write("%st%dt"%(i[0],i[1]))
    result.write("n")
for k,v in d2.iteritems():
    cnt2 = Counter(v)
    #print cnt2
    result.write("%st" % k)
    for i in sorted(cnt2.items(), key = lambda x: x[1], reverse=False):
        result.write("%st%dt"%( i[0],i[1]))
    result.write("n")
#t1=time.clock()
#print (t1-t0)

更多关于Python相关内容感兴趣的读者可查看本站专题：《Python文件与目录操作技巧汇总》、《Python文本文件操作技巧汇总》、《Python URL操作技巧总结》、《Python图片操作技巧总结》、《Python数据结构与算法教程》、《Python Socket编程技巧总结》、《Python函数使用技巧总结》、《Python字符串操作技巧汇总》及《Python入门与进阶经典教程》

希望本文所述对大家Python程序设计有所帮助。

Python实现读取并保存文件的类
本文实例讲述了Python实现读取并保存文件的类。分享给大家供大家参考，具体如下：这个类写在一个叫class_format.py的文件里，放在D盘importosos.chdir("D:\")o

python 读取excel文件生成sql文件实例详解
python读取excel文件生成sql文件实例详解学了python这么久，总算是在工作中用到一次。这次是为了从excel文件中读取数据然后写入到数据库中。这个逻辑用j

使用Python对Csv文件操作实例代码
csv是Comma-SeparatedValues的缩写，是用文本文件形式储存的表格数据，比如如下的表格：就可以存储为csv文件，文件内容是：No.,Name,Age,Score1,mayi,18,992,jack,21,8